Izolacja koniecznie ze wszystkich stron. Nie ma znaczenia, że ciepło idzie do góry. Stratyfikacja temperatury oczywiście będzie miała miejsce, ale jeśli spód będzie niezaizolowany to straty będą pokaźne.
Nie masz na to projektu? Projektant powinien dobrać wymiary kanałów do wentylacji kotłowni.
Kanał nawiewny - bo o nim mówisz? dobiera się zależnie od mocy kotłowni. Przy takich długościach zastosowałbym większy przekrój kanału, żeby być po bezpiecznej stronie.