Kocioł pelletowy czyści się bardzo rzadko ze względu na czyste i ekologiczne paliwo. Radzę nie żałować kasy i kupić certyfikowany pellet wtedy czyszczenia będzie mniej. Najlepszy jest wymiennik pionowy ze względu na lepszy odbiór ciepła (efektywniejsze zawirowywacze) oraz wolniejsze zanieczyszczanie ścianek z szufladką na popiół.